白天跟测序数据较劲,晚上给 AI 写插件。
武汉大学生物信息学博士,即将毕业。从生信脚本、终端配置一路折腾到 AI Agent 插件、长期记忆和 ComfyUI,这里收着做过的项目、踩过的坑,还有一些没什么用但挺好玩的东西。
最近在做
全部 31 个项目
Venusleeyous:2021.03.29–2026.11.01
11 篇 / 4 条轨道
最近的笔记
全部 11 篇- pybiotk:把四年的生信脚本攒成一个工具包 gtf 转 bed、统计 fragment 长度、表格按列去重……这些当年写在博客里的轮子,后来都被收进了 pybiotk。现在它有 30 个命令行工具,pip 一行就能装。
- python将列表按指定的列去重,并合并其它行的内容 pandas的drop_duplicates在按某列去重时,其他列每组只能保留其中一行。如何把这一组的若干行合并在一行,是本文主要解决的问题。
- 统计bam文件中的fragments长度分布 输入bam文件,输出两列,一列是fragment的长度,一列是数量。不愧是python,就是慢。
- python按长度拆分容器 一个python烂活,输入任意长度列表,根据长度列表对容器进行拆分。
- 在WSL2中安装ArchLinux并进行本地化配置 微软商店没有ArchLinux官方版本的WSL,不过我们可以使用LxRunOffline安装。
- git撤销操作,添加代理以及wget设置代理 这些东西都能搜到,但也容易忘记,记录在此方便查阅。