白天跟测序数据较劲,晚上给 AI 写插件。

武汉大学生物信息学博士,即将毕业。从生信脚本、终端配置一路折腾到 AI Agent 插件、长期记忆和 ComfyUI,这里收着做过的项目、踩过的坑,还有一些没什么用但挺好玩的东西。

最近在做

全部 31 个项目
Venusleeyous:2021.03.29–2026.11.01 11 篇 / 4 条轨道
每个色块是一篇笔记,按写下的日期排在时间轴上,一行一个分类。点一下就能打开。

最近的笔记

全部 11 篇
  1. pybiotk:把四年的生信脚本攒成一个工具包 生信 6 分钟 gtf 转 bed、统计 fragment 长度、表格按列去重……这些当年写在博客里的轮子,后来都被收进了 pybiotk。现在它有 30 个命令行工具,pip 一行就能装。
  2. python将列表按指定的列去重,并合并其它行的内容 python 3 分钟 pandas的drop_duplicates在按某列去重时,其他列每组只能保留其中一行。如何把这一组的若干行合并在一行,是本文主要解决的问题。
  3. 统计bam文件中的fragments长度分布 生信 3 分钟 输入bam文件,输出两列,一列是fragment的长度,一列是数量。不愧是python,就是慢。
  4. python按长度拆分容器 python 2 分钟 一个python烂活,输入任意长度列表,根据长度列表对容器进行拆分。
  5. 在WSL2中安装ArchLinux并进行本地化配置 终端与环境 7 分钟 微软商店没有ArchLinux官方版本的WSL,不过我们可以使用LxRunOffline安装。
  6. git撤销操作,添加代理以及wget设置代理 终端与环境 2 分钟 这些东西都能搜到,但也容易忘记,记录在此方便查阅。
Venuslee 的头像

你好,我是 Venuslee

生物信息学博士,快毕业了。最早写这个博客时我还在读研,电脑里塞满了跑到一半的脚本和改了八遍的配置文件。后来兴趣一路拐进了 AI Agent,开始给各种宿主写插件和 Skills。这里两边的东西都记,如果某篇刚好帮你省下一个下午,那它就没白写。