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12 篇笔记,从最新踩的坑开始往回翻。
- pybiotk:把四年的生信脚本攒成一个工具包 gtf 转 bed、统计 fragment 长度、表格按列去重……这些当年写在博客里的轮子,后来都被收进了 pybiotk。现在它有 30 个命令行工具,pip 一行就能装。
- de-astra:把 AI 写的科研文稿改回人话 gpt-6-astra 整理文献和写稿很严谨,可写出来的东西满是工程黑话和层层叠叠的否定句,导师一眼就看出是 AI 写的。于是写了个 Skill 专门治它,顺便聊聊另外两个给小说去 AI 味的 Skill。
- python将列表按指定的列去重,并合并其它行的内容 pandas的drop_duplicates在按某列去重时,其他列每组只能保留其中一行。如何把这一组的若干行合并在一行,是本文主要解决的问题。
- 统计bam文件中的fragments长度分布 输入bam文件,输出两列,一列是fragment的长度,一列是数量。不愧是python,就是慢。
- python按长度拆分容器 一个python烂活,输入任意长度列表,根据长度列表对容器进行拆分。
- 在WSL2中安装ArchLinux并进行本地化配置 微软商店没有ArchLinux官方版本的WSL,不过我们可以使用LxRunOffline安装。
- git撤销操作,添加代理以及wget设置代理 这些东西都能搜到,但也容易忘记,记录在此方便查阅。
- Python如何让两个变量保持同步 python就这?连个引用都没有。卖课公众号还好意思吹什么无所不能的编程语言呢。就这?
- gtf转bed,提取intron.bed以及一个处理gtf的轮子 如果你只需要把gtf转成bed12,下载ucsc的两个软件genePredToBed,gtfToGenePred一行代码就完事了。如果你想看看怎么用python实现它,可以看看这个。
- 大幅度提升终端使用体验——zsh安装与配置 如果你没用过zsh,那么你需要这篇文章,如果你没用过oh-my-zsh,那你更需要这篇文章。如果你不用oh-my-zsh,那没事了。
- 配置你的vim,让它成为能用的编辑器 很多服务器上的至今仍然装着vim7,没有基本的配置,vim是很难用的,经常会遇到空格和tab混用的问题。使用vim,需要先从配置开始。
- 欢迎来到我的小站 这是我全程用旧手机慢慢爬的小破站,遇到问题全靠百度,正在建设中……
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